As tarifas de importação do Japão são um peso a mais para a venda de álcool brasileiro. Cada litro do biocombustível paga 38 ienes, equivalentes a R$ 0,54. O valor corresponde quase ao valor do litro produzido pelas principais usinas da região Centro-Sul do país.

Apesar da incidência das tarifas, o Japão é um bom parceiro importador do etanol brasileiro. Em 2007, importou o equivalente a US$ 152,6 milhões, segundo o Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (Mapa). O balanço, no entanto, explica que o álcool exportado é o etílico, empregado pela indústria de bebidas.