Indicado por Renan Calheiros em 2003 ao cargo de presidente da Transpetro, subsidiária de logística da Petrobras, Sérgio Machado aproveitou para pedir a sua renúncia do cargo um dia após Graça Foster. Citado pelo delator Paulo Roberto Costa, ele estava há três meses de licença não remunerada. Com a reeleição de Renan à presidência do Senado, parece que Sérgio Machado só estava esquentando a cadeira para a próxima indicação política de seu tutor ao cargo.

A Transpetro não comentou o caso e Sérgio Machado também não explicou os motivos de sua saída. A sua demissão foi entregue à Graça Foster, presidente do Conselho de Administração da Transpetro.